Le Comité des Nations unies contre la torture dénonce, lors de l’examen périodique du 28 avril 2016, les actes de violence infligés aux personnes arrêtées et détenues. Elles subissent couramment des coups de poings et de pieds, des chocs électriques et des simulations de noyade. Une rapporteuse du Comité déclare : “*Les personnes en détention sont systématiquement soumises à la torture avec les méthodes les plus abjectes”.* Elle impute ces abus à l’organisation défaillante de la justice, l’absence d’enregistrement systématique des prisonniers et à l’irrespect du droit à la défense.
Des lieux de détention secrets sont le théâtre de tortures. Des enquêtes gouvernementales entamées, en 2015, sur un lieu situé dans la province de Laguna, ne progressent pas. Les policiers y feraient tourner une roue pour choisir le moyen de torture à employer.

La Commission des droits humains (CHR) est l’institution indépendante chargée du contrôle du respect des droits fondamentaux par les autorités. Elle inspecte les lieux de détention en y effectuant des visites. Elle reçoit les plaintes alléguant de violations des droits humains, notamment de la part des prisonniers, de leur avocat ou de leur famille. Elle les renvoie aux organes concernés. Elle peut fournir un service indépendant de médecine légale et soutenir les enquêtes. Elle fait la promotion des droits humains par le plaidoyer, la recherche et l’éducation.
Le Comité des Nations unies contre la torture met en lumière, en avril 2016, les limites de la CHR. Celle-ci ne peut pas visiter les lieux de détention relevant de l’armée. Elle ne dispose pas de moyens suffisants pour contrôler efficacement la multitude de prisons. La question se pose de savoir si elle est en capacité d’effectuer des visites inopinées et de rendre ses rapports de visite publics.